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植物ゲノム進化研究チーム

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チームリーダー
風間 裕介Yusuke KAZAMA Ph.D.
    準備中

研究室プロフィール

アルゴンや鉄などの重いイオンを植物に照射すると、染色体が断片化します。染色体断片は植物がもつ修復機構により再結合しますが、元通りに修復することができず、転座、逆位、大規模欠失などの染色体再編成が生じます。私たちは、遺伝子発現パターンやクロマチン(DNAとタンパク質の複合体)の状態変化を解析することで、染色体再編成が植物の形質に与える影響を調査しています。また、植物性決定遺伝子の同定および植物性染色体の構築過程の解析により、染色体再編成と進化に関する研究を推進します。

主要論文

  1. Kazama Y., Ishii K., Hirano T., Wakana T., Yamada M., Ohbu S., and Abe T.:
    “Different mutational function of low- and high-linear energy transfer heavy-ion irradiation demonstrated by whole genome re-sequencing of Arabidopsis mutants”
    Plant J. 92, 1020-1030 (2017)
  2. Ishii K., Kazama Y., Hirano T., Hamada M., Ono Y., Yamada M., and Abe T.:
    “AMAP: A pipeline for whole-genome mutation detection in Arabidopsis thaliana”
    Genes Genet. Syst. 91, 229-233 (2016)
  3. Kazama Y., Ishii K., Aonuma W., Ikeda T., Kawamoto H., Koizumi A., Filatov D.A., Chibalina M., Bergero R., Charlesworth D., Abe T., and Kawano S.:
    “A new physical mapping approach refines the sex-determining gene positions on the Silene latifolia Y-chromosome”
    Sci. Rep. 6,18917 (2016)
  4. Katano M., Takahashi K., Hirano T., Kazama Y., Abe T., Tsukaya H., and Ferjani A.:
    “Suppressor screen and phenotype analyses revealed an emerging role of the monofunctional peroxisomal enoyl-CoA hydratase 2 in compensated cell enlargement”
    Front. Plant. Sci. 7, 132 (2016)
  5. Yamada K, Suzuki H, Takeuchi T, Kazama Y, Mitra S, Abe T, Goda K, Suzuki K, and Iwata O.:
    “Efficient selective breeding of live oil-rich Euglena gracilis with fluorescence-activated cell sorting”
    Sci. Rep. 6, 26327 (2016)
  6. Hirano T., Kazama Y., Ishii K., Ohbu S., Shirakawa Y., and Abe T.:
    “Comprehensive identification of mutations induced by heavy‐ion beam irradiation in Arabidopsis thaliana”
    Plant J. 82, 93–104 (2015)
  7. Kazama Y., Fujiwara M.T., Takehisa H., Ohbu S., Saito H., Ichida H., Hayashi Y., and Abe T.:
    “Characterization of a heavy-ion induced white flower mutant of allotetraploid Nicotiana tabacum”
    Plant Cell Rep. 32, 11–19 (2013).
  8. Kazama Y., Nishihara K., Bergero R., Fujiwara M.T., Abe T., Charlesworth D., and Kawano S.:
    “SlWUS1; An X-linked Gene Having No Homologous Y-Linked Copy in Silene latifolia”
    G3 2, 1269-1278 (2012)
  9. Kazama Y., Hirano T., Saito H., Liu Y., Ohbu S., Hayashi Y., and Abe T.:
    “Characterization of highly efficient heavy-ion mutagenesis in Arabidopsis thaliana”
    BMC Plant Biol. 11, 161 (2011).
  10. Kazama Y., Fujiwara M.T., Koizumi A., Nishihara K., Nishiyama R., Kifune E., Abe T., and Kawano S.:
    “A SUPERMAN-like gene is exclusively expressed in female flowers of the dioecious plant Silene latifolia” Plant Cell Physiol. 50, 1127-1141(2009).

 

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